Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r236Q05A06 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r236Q05A06 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r236Q05A06 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms