Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Thbs3Q05895 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Thbs3Q05895 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms