Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcad1Q04692 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smarcad1Q04692 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smarcad1Q04692 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1611.8 ms