Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpd1Q04519 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smpd1Q04519 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smpd1Q04519 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms