Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GscQ02591 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GscQ02591 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GscQ02591 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GscQ02591 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GscQ02591 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GscQ02591 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GscQ02591 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GscQ02591 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GscQ02591 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GscQ02591 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GscQ02591 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GscQ02591 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GscQ02591 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GscQ02591 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GscQ02591 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GscQ02591 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GscQ02591 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GscQ02591 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GscQ02591 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GscQ02591 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GscQ02591 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GscQ02591 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GscQ02591 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GscQ02591 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GscQ02591 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GscQ02591 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GscQ02591 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GscQ02591 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GscQ02591 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GscQ02591 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GscQ02591 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GscQ02591 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GscQ02591 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GscQ02591 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GscQ02591 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GscQ02591 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GscQ02591 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GscQ02591 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GscQ02591 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GscQ02591 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GscQ02591 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GscQ02591 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GscQ02591 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GscQ02591 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GscQ02591 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GscQ02591 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GscQ02591 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GscQ02591 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GscQ02591 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GscQ02591 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GscQ02591 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GscQ02591 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GscQ02591 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GscQ02591 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GscQ02591 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GscQ02591 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GscQ02591 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GscQ02591 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GscQ02591 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GscQ02591 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GscQ02591 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GscQ02591 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GscQ02591 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GscQ02591 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GscQ02591 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GscQ02591 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GscQ02591 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GscQ02591 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GscQ02591 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GscQ02591 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GscQ02591 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GscQ02591 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GscQ02591 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GscQ02591 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GscQ02591 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GscQ02591 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GscQ02591 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GscQ02591 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GscQ02591 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GscQ02591 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GscQ02591 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GscQ02591 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GscQ02591 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GscQ02591 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GscQ02591 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GscQ02591 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GscQ02591 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GscQ02591 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GscQ02591 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GscQ02591 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GscQ02591 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GscQ02591 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GscQ02591 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GscQ02591 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GscQ02591 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GscQ02591 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GscQ02591 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GscQ02591 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GscQ02591 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms