Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Zfp39Q02525 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zfp39Q02525 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Zfp39Q02525 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms