Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nme2Q01768 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nme2Q01768 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nme2Q01768 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nme2Q01768 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms