Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp1Q01514 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp1Q01514 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp1Q01514 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms