Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HmgcrQ01237 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HmgcrQ01237 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HmgcrQ01237 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms