Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col1a2Q01149 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col1a2Q01149 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Col1a2Q01149 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col1a2Q01149 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col1a2Q01149 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms