Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SelpQ01102 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SelpQ01102 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SelpQ01102 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SelpQ01102 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SelpQ01102 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SelpQ01102 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SelpQ01102 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SelpQ01102 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SelpQ01102 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SelpQ01102 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SelpQ01102 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SelpQ01102 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SelpQ01102 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SelpQ01102 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SelpQ01102 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SelpQ01102 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SelpQ01102 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SelpQ01102 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SelpQ01102 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SelpQ01102 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SelpQ01102 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SelpQ01102 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SelpQ01102 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SelpQ01102 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SelpQ01102 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms