Protein–RNA interactions for Protein: Q00941

Csf2ra, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2raQ00941 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csf2raQ00941 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Csf2raQ00941 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csf2raQ00941 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Csf2raQ00941 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csf2raQ00941 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csf2raQ00941 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csf2raQ00941 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csf2raQ00941 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Csf2raQ00941 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csf2raQ00941 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csf2raQ00941 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csf2raQ00941 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csf2raQ00941 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csf2raQ00941 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csf2raQ00941 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csf2raQ00941 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csf2raQ00941 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csf2raQ00941 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csf2raQ00941 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms