Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp4Q00724 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbp4Q00724 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbp4Q00724 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms