Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Il6stQ00560 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Il6stQ00560 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Il6stQ00560 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Il6stQ00560 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Il6stQ00560 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Il6stQ00560 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Il6stQ00560 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Il6stQ00560 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Il6stQ00560 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Il6stQ00560 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Il6stQ00560 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Il6stQ00560 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Il6stQ00560 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Il6stQ00560 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Il6stQ00560 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.8 ms