Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
F8a1Q00558 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F8a1Q00558 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F8a1Q00558 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
F8a1Q00558 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8a1Q00558 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
F8a1Q00558 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8a1Q00558 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
F8a1Q00558 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8a1Q00558 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8a1Q00558 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
F8a1Q00558 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8a1Q00558 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8a1Q00558 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8a1Q00558 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F8a1Q00558 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8a1Q00558 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8a1Q00558 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8a1Q00558 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8a1Q00558 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8a1Q00558 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.3■■□□□ 1
F8a1Q00558 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
F8a1Q00558 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F8a1Q00558 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.3■■□□□ 1
F8a1Q00558 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F8a1Q00558 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.3■■□□□ 1
F8a1Q00558 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8a1Q00558 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8a1Q00558 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8a1Q00558 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8a1Q00558 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8a1Q00558 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8a1Q00558 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8a1Q00558 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.29■■□□□ 1
F8a1Q00558 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F8a1Q00558 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F8a1Q00558 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
F8a1Q00558 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F8a1Q00558 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F8a1Q00558 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F8a1Q00558 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F8a1Q00558 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F8a1Q00558 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F8a1Q00558 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
F8a1Q00558 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F8a1Q00558 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
F8a1Q00558 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F8a1Q00558 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
F8a1Q00558 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
F8a1Q00558 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms