Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
AlkP97793 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
AlkP97793 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
AlkP97793 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
AlkP97793 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
AlkP97793 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
AlkP97793 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
AlkP97793 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
AlkP97793 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
AlkP97793 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
AlkP97793 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
AlkP97793 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
AlkP97793 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
AlkP97793 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
AlkP97793 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
AlkP97793 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
AlkP97793 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
AlkP97793 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
AlkP97793 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
AlkP97793 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
AlkP97793 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
AlkP97793 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
AlkP97793 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
AlkP97793 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
AlkP97793 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
AlkP97793 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
AlkP97793 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
AlkP97793 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
AlkP97793 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
AlkP97793 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
AlkP97793 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
AlkP97793 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
AlkP97793 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
AlkP97793 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
AlkP97793 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
AlkP97793 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
AlkP97793 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
AlkP97793 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
AlkP97793 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
AlkP97793 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
AlkP97793 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
AlkP97793 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
AlkP97793 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
AlkP97793 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
AlkP97793 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
AlkP97793 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
AlkP97793 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
AlkP97793 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
AlkP97793 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
AlkP97793 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
AlkP97793 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
AlkP97793 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
AlkP97793 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
AlkP97793 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
AlkP97793 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
AlkP97793 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
AlkP97793 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
AlkP97793 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
AlkP97793 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
AlkP97793 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
AlkP97793 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
AlkP97793 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
AlkP97793 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
AlkP97793 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
AlkP97793 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
AlkP97793 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
AlkP97793 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
AlkP97793 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
AlkP97793 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
AlkP97793 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
AlkP97793 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
AlkP97793 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
AlkP97793 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
AlkP97793 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
AlkP97793 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
AlkP97793 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
AlkP97793 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
AlkP97793 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
AlkP97793 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
AlkP97793 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
AlkP97793 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
AlkP97793 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
AlkP97793 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
AlkP97793 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
AlkP97793 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
AlkP97793 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
AlkP97793 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
AlkP97793 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
AlkP97793 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
AlkP97793 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
AlkP97793 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
AlkP97793 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
AlkP97793 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
AlkP97793 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
AlkP97793 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
AlkP97793 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
AlkP97793 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
AlkP97793 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
AlkP97793 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
AlkP97793 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms