Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tarbp2P97473 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tarbp2P97473 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tarbp2P97473 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tarbp2P97473 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms