Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npas2P97460 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Npas2P97460 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas2P97460 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas2P97460 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas2P97460 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Npas2P97460 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npas2P97460 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npas2P97460 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Npas2P97460 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas2P97460 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas2P97460 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas2P97460 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas2P97460 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npas2P97460 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Npas2P97460 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms