Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nbr1P97432 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nbr1P97432 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nbr1P97432 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nbr1P97432 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms