Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp1b3P97370 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atp1b3P97370 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atp1b3P97370 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atp1b3P97370 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms