Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Taf1bP97358 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Taf1bP97358 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms