Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec1P97353 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec1P97353 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec1P97353 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec1P97353 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec1P97353 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sec1P97353 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec1P97353 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec1P97353 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec1P97353 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec1P97353 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sec1P97353 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms