Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim43bP86448 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim43bP86448 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms