Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otx2P80206 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Otx2P80206 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Otx2P80206 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Otx2P80206 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otx2P80206 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Otx2P80206 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Otx2P80206 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otx2P80206 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx2P80206 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx2P80206 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Otx2P80206 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Otx2P80206 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms