Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Polr1bP70700 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr1bP70700 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms