Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf3P70671 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf3P70671 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf3P70671 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf3P70671 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Irf3P70671 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf3P70671 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf3P70671 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf3P70671 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf3P70671 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf3P70671 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf3P70671 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irf3P70671 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf3P70671 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms