Protein–RNA interactions for Protein: P70434

Irf7, Interferon regulatory factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf7P70434 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf7P70434 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf7P70434 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf7P70434 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf7P70434 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf7P70434 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf7P70434 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf7P70434 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf7P70434 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf7P70434 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf7P70434 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf7P70434 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf7P70434 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf7P70434 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms