Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gfi1P70338 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gfi1P70338 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gfi1P70338 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms