Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Aup1P70295 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aup1P70295 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aup1P70295 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aup1P70295 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aup1P70295 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aup1P70295 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aup1P70295 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aup1P70295 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Aup1P70295 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aup1P70295 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Aup1P70295 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Aup1P70295 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aup1P70295 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aup1P70295 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aup1P70295 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aup1P70295 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aup1P70295 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Aup1P70295 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Aup1P70295 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Aup1P70295 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Aup1P70295 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aup1P70295 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aup1P70295 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aup1P70295 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Aup1P70295 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aup1P70295 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aup1P70295 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aup1P70295 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aup1P70295 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Aup1P70295 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aup1P70295 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms