Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DccP70211 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DccP70211 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DccP70211 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DccP70211 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DccP70211 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DccP70211 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DccP70211 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
DccP70211 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
DccP70211 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
DccP70211 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DccP70211 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DccP70211 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
DccP70211 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DccP70211 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DccP70211 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
DccP70211 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DccP70211 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DccP70211 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DccP70211 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DccP70211 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DccP70211 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DccP70211 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DccP70211 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DccP70211 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DccP70211 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DccP70211 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DccP70211 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DccP70211 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DccP70211 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
DccP70211 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DccP70211 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DccP70211 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DccP70211 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DccP70211 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DccP70211 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DccP70211 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DccP70211 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DccP70211 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DccP70211 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DccP70211 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DccP70211 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DccP70211 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DccP70211 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DccP70211 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DccP70211 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DccP70211 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DccP70211 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DccP70211 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DccP70211 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DccP70211 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DccP70211 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DccP70211 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DccP70211 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DccP70211 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DccP70211 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DccP70211 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DccP70211 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DccP70211 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DccP70211 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
DccP70211 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DccP70211 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DccP70211 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DccP70211 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DccP70211 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DccP70211 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DccP70211 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DccP70211 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DccP70211 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DccP70211 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DccP70211 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DccP70211 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DccP70211 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DccP70211 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DccP70211 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DccP70211 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DccP70211 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DccP70211 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DccP70211 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DccP70211 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DccP70211 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DccP70211 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DccP70211 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DccP70211 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DccP70211 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DccP70211 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DccP70211 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DccP70211 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DccP70211 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DccP70211 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DccP70211 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DccP70211 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DccP70211 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DccP70211 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DccP70211 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DccP70211 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DccP70211 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DccP70211 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DccP70211 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DccP70211 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms