Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtnP63089 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtnP63089 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtnP63089 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtnP63089 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtnP63089 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtnP63089 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtnP63089 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtnP63089 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtnP63089 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtnP63089 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtnP63089 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtnP63089 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtnP63089 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtnP63089 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PtnP63089 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtnP63089 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtnP63089 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtnP63089 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtnP63089 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtnP63089 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtnP63089 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PtnP63089 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtnP63089 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtnP63089 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtnP63089 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PtnP63089 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtnP63089 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
PtnP63089 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PtnP63089 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PtnP63089 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PtnP63089 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtnP63089 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PtnP63089 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtnP63089 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtnP63089 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtnP63089 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PtnP63089 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtnP63089 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtnP63089 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtnP63089 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtnP63089 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtnP63089 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtnP63089 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtnP63089 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtnP63089 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtnP63089 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtnP63089 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtnP63089 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtnP63089 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtnP63089 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtnP63089 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtnP63089 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtnP63089 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms