Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp3P63024 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp3P63024 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms