Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uba52P62984 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uba52P62984 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uba52P62984 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uba52P62984 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Uba52P62984 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uba52P62984 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Uba52P62984 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uba52P62984 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Uba52P62984 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Uba52P62984 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uba52P62984 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uba52P62984 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uba52P62984 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Uba52P62984 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uba52P62984 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba52P62984 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba52P62984 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uba52P62984 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uba52P62984 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Uba52P62984 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Uba52P62984 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms