Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ElobP62869 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ElobP62869 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ElobP62869 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ElobP62869 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ElobP62869 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ElobP62869 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ElobP62869 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ElobP62869 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ElobP62869 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ElobP62869 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ElobP62869 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ElobP62869 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ElobP62869 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ElobP62869 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ElobP62869 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ElobP62869 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ElobP62869 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ElobP62869 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ElobP62869 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ElobP62869 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ElobP62869 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ElobP62869 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ElobP62869 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ElobP62869 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ElobP62869 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ElobP62869 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ElobP62869 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ElobP62869 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ElobP62869 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ElobP62869 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ElobP62869 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ElobP62869 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ElobP62869 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ElobP62869 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ElobP62869 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ElobP62869 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ElobP62869 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ElobP62869 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ElobP62869 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ElobP62869 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ElobP62869 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ElobP62869 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ElobP62869 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ElobP62869 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ElobP62869 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ElobP62869 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ElobP62869 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ElobP62869 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ElobP62869 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ElobP62869 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ElobP62869 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ElobP62869 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ElobP62869 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ElobP62869 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ElobP62869 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ElobP62869 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ElobP62869 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ElobP62869 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ElobP62869 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ElobP62869 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ElobP62869 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ElobP62869 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ElobP62869 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ElobP62869 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ElobP62869 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ElobP62869 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ElobP62869 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ElobP62869 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ElobP62869 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ElobP62869 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ElobP62869 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ElobP62869 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ElobP62869 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ElobP62869 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ElobP62869 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ElobP62869 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ElobP62869 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ElobP62869 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ElobP62869 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ElobP62869 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ElobP62869 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ElobP62869 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ElobP62869 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ElobP62869 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ElobP62869 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ElobP62869 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ElobP62869 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ElobP62869 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ElobP62869 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ElobP62869 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ElobP62869 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ElobP62869 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ElobP62869 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ElobP62869 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ElobP62869 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ElobP62869 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ElobP62869 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ElobP62869 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ElobP62869 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms