Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps28P62858 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps28P62858 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rps28P62858 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps28P62858 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps28P62858 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps28P62858 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps28P62858 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps28P62858 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rps28P62858 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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