Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl23aP62751 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpl23aP62751 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rpl23aP62751 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.2 ms