Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lmo4P61969 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmo4P61969 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmo4P61969 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms