Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arf3P61205 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arf3P61205 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arf3P61205 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arf3P61205 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arf3P61205 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arf3P61205 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arf3P61205 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arf3P61205 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arf3P61205 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arf3P61205 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arf3P61205 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arf3P61205 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arf3P61205 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arf3P61205 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arf3P61205 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Arf3P61205 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arf3P61205 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arf3P61205 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arf3P61205 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf3P61205 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf3P61205 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arf3P61205 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arf3P61205 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arf3P61205 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arf3P61205 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arf3P61205 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arf3P61205 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Arf3P61205 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms