Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sem1P60897 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sem1P60897 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sem1P60897 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sem1P60897 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sem1P60897 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sem1P60897 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sem1P60897 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sem1P60897 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms