Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ActbP60710 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ActbP60710 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ActbP60710 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ActbP60710 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ActbP60710 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ActbP60710 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ActbP60710 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ActbP60710 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ActbP60710 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ActbP60710 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ActbP60710 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ActbP60710 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ActbP60710 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ActbP60710 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ActbP60710 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ActbP60710 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ActbP60710 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ActbP60710 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ActbP60710 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ActbP60710 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ActbP60710 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ActbP60710 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ActbP60710 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ActbP60710 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ActbP60710 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ActbP60710 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ActbP60710 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ActbP60710 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ActbP60710 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ActbP60710 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ActbP60710 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ActbP60710 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ActbP60710 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ActbP60710 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ActbP60710 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ActbP60710 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ActbP60710 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ActbP60710 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ActbP60710 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ActbP60710 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ActbP60710 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ActbP60710 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ActbP60710 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ActbP60710 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ActbP60710 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ActbP60710 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ActbP60710 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ActbP60710 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ActbP60710 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ActbP60710 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ActbP60710 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ActbP60710 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ActbP60710 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ActbP60710 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ActbP60710 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ActbP60710 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ActbP60710 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ActbP60710 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ActbP60710 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ActbP60710 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ActbP60710 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ActbP60710 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ActbP60710 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ActbP60710 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ActbP60710 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ActbP60710 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ActbP60710 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ActbP60710 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ActbP60710 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ActbP60710 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ActbP60710 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ActbP60710 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ActbP60710 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ActbP60710 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ActbP60710 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ActbP60710 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ActbP60710 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ActbP60710 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ActbP60710 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ActbP60710 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ActbP60710 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ActbP60710 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ActbP60710 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ActbP60710 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ActbP60710 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ActbP60710 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ActbP60710 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ActbP60710 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ActbP60710 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ActbP60710 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ActbP60710 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ActbP60710 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ActbP60710 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ActbP60710 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ActbP60710 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ActbP60710 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ActbP60710 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ActbP60710 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ActbP60710 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms