Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Snrpa1P57784 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snrpa1P57784 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Snrpa1P57784 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms