Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TdgP56581 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TdgP56581 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TdgP56581 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TdgP56581 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TdgP56581 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TdgP56581 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TdgP56581 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TdgP56581 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TdgP56581 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TdgP56581 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TdgP56581 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TdgP56581 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TdgP56581 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TdgP56581 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TdgP56581 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TdgP56581 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TdgP56581 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TdgP56581 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TdgP56581 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TdgP56581 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TdgP56581 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TdgP56581 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TdgP56581 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TdgP56581 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TdgP56581 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TdgP56581 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TdgP56581 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TdgP56581 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TdgP56581 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TdgP56581 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TdgP56581 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TdgP56581 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TdgP56581 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TdgP56581 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TdgP56581 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TdgP56581 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TdgP56581 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TdgP56581 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TdgP56581 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TdgP56581 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TdgP56581 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TdgP56581 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TdgP56581 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TdgP56581 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TdgP56581 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TdgP56581 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TdgP56581 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TdgP56581 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TdgP56581 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TdgP56581 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TdgP56581 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TdgP56581 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TdgP56581 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TdgP56581 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TdgP56581 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TdgP56581 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TdgP56581 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TdgP56581 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TdgP56581 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TdgP56581 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TdgP56581 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TdgP56581 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TdgP56581 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TdgP56581 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TdgP56581 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TdgP56581 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TdgP56581 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TdgP56581 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TdgP56581 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TdgP56581 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TdgP56581 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TdgP56581 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TdgP56581 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TdgP56581 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TdgP56581 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TdgP56581 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TdgP56581 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TdgP56581 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TdgP56581 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TdgP56581 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TdgP56581 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TdgP56581 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TdgP56581 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TdgP56581 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TdgP56581 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TdgP56581 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TdgP56581 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TdgP56581 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TdgP56581 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TdgP56581 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TdgP56581 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TdgP56581 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TdgP56581 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TdgP56581 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TdgP56581 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TdgP56581 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TdgP56581 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TdgP56581 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TdgP56581 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms