Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf5P56477 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf5P56477 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Irf5P56477 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irf5P56477 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf5P56477 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf5P56477 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Irf5P56477 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irf5P56477 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irf5P56477 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irf5P56477 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irf5P56477 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irf5P56477 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Irf5P56477 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms