Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gp1bbP56400 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gp1bbP56400 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gp1bbP56400 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms