Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtskP55097 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtskP55097 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtskP55097 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtskP55097 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtskP55097 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtskP55097 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CtskP55097 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtskP55097 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtskP55097 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtskP55097 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtskP55097 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtskP55097 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtskP55097 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtskP55097 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtskP55097 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtskP55097 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtskP55097 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtskP55097 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtskP55097 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtskP55097 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtskP55097 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtskP55097 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtskP55097 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtskP55097 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtskP55097 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtskP55097 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtskP55097 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtskP55097 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtskP55097 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtskP55097 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtskP55097 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtskP55097 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtskP55097 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtskP55097 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtskP55097 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtskP55097 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtskP55097 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtskP55097 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtskP55097 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtskP55097 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtskP55097 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtskP55097 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtskP55097 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtskP55097 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtskP55097 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtskP55097 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtskP55097 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtskP55097 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtskP55097 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtskP55097 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtskP55097 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtskP55097 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtskP55097 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtskP55097 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtskP55097 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtskP55097 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtskP55097 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtskP55097 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtskP55097 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtskP55097 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtskP55097 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtskP55097 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtskP55097 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtskP55097 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CtskP55097 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtskP55097 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtskP55097 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtskP55097 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtskP55097 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtskP55097 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtskP55097 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CtskP55097 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtskP55097 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtskP55097 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CtskP55097 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtskP55097 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtskP55097 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtskP55097 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CtskP55097 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtskP55097 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtskP55097 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtskP55097 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtskP55097 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtskP55097 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtskP55097 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtskP55097 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CtskP55097 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtskP55097 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtskP55097 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtskP55097 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtskP55097 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CtskP55097 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtskP55097 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtskP55097 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtskP55097 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtskP55097 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtskP55097 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtskP55097 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtskP55097 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms