Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NcanP55066 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NcanP55066 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NcanP55066 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NcanP55066 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NcanP55066 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NcanP55066 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NcanP55066 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NcanP55066 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NcanP55066 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NcanP55066 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NcanP55066 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NcanP55066 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NcanP55066 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NcanP55066 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NcanP55066 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NcanP55066 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NcanP55066 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NcanP55066 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NcanP55066 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NcanP55066 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NcanP55066 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NcanP55066 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NcanP55066 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NcanP55066 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NcanP55066 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NcanP55066 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NcanP55066 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NcanP55066 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NcanP55066 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NcanP55066 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NcanP55066 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NcanP55066 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NcanP55066 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NcanP55066 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NcanP55066 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NcanP55066 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NcanP55066 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NcanP55066 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NcanP55066 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NcanP55066 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NcanP55066 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NcanP55066 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NcanP55066 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NcanP55066 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NcanP55066 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NcanP55066 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NcanP55066 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NcanP55066 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NcanP55066 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NcanP55066 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NcanP55066 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NcanP55066 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NcanP55066 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NcanP55066 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NcanP55066 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NcanP55066 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NcanP55066 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NcanP55066 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NcanP55066 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NcanP55066 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NcanP55066 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NcanP55066 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NcanP55066 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NcanP55066 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NcanP55066 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NcanP55066 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NcanP55066 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NcanP55066 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NcanP55066 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NcanP55066 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NcanP55066 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NcanP55066 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NcanP55066 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NcanP55066 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NcanP55066 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NcanP55066 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NcanP55066 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NcanP55066 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NcanP55066 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NcanP55066 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NcanP55066 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NcanP55066 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NcanP55066 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NcanP55066 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NcanP55066 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NcanP55066 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NcanP55066 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NcanP55066 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NcanP55066 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NcanP55066 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NcanP55066 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NcanP55066 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NcanP55066 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NcanP55066 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NcanP55066 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NcanP55066 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NcanP55066 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NcanP55066 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NcanP55066 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms