Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GemP55041 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GemP55041 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GemP55041 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GemP55041 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GemP55041 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GemP55041 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GemP55041 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GemP55041 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GemP55041 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GemP55041 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GemP55041 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GemP55041 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GemP55041 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GemP55041 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GemP55041 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GemP55041 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GemP55041 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GemP55041 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GemP55041 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GemP55041 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GemP55041 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GemP55041 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GemP55041 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GemP55041 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GemP55041 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GemP55041 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GemP55041 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GemP55041 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GemP55041 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GemP55041 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GemP55041 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GemP55041 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GemP55041 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GemP55041 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GemP55041 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GemP55041 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GemP55041 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GemP55041 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GemP55041 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GemP55041 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GemP55041 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GemP55041 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GemP55041 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GemP55041 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GemP55041 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GemP55041 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GemP55041 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GemP55041 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GemP55041 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GemP55041 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GemP55041 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GemP55041 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GemP55041 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GemP55041 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GemP55041 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GemP55041 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GemP55041 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GemP55041 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GemP55041 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GemP55041 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GemP55041 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GemP55041 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GemP55041 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GemP55041 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GemP55041 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GemP55041 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GemP55041 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GemP55041 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GemP55041 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GemP55041 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GemP55041 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GemP55041 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GemP55041 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GemP55041 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GemP55041 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GemP55041 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GemP55041 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GemP55041 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GemP55041 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GemP55041 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GemP55041 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GemP55041 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GemP55041 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GemP55041 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GemP55041 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GemP55041 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GemP55041 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GemP55041 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GemP55041 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GemP55041 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GemP55041 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GemP55041 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GemP55041 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GemP55041 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GemP55041 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GemP55041 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GemP55041 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GemP55041 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GemP55041 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms