Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClgnP52194 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ClgnP52194 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClgnP52194 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClgnP52194 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ClgnP52194 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClgnP52194 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ClgnP52194 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ClgnP52194 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ClgnP52194 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClgnP52194 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClgnP52194 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClgnP52194 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ClgnP52194 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClgnP52194 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClgnP52194 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ClgnP52194 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ClgnP52194 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms