Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccr1P51675 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccr1P51675 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccr1P51675 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.8 ms