Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Defa-rs12P50716 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Defa-rs12P50716 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms